- neexistuje obecně akceptované API (ODL, ODMG, JDO)
- OQL nemá takové možnosti jako SQL
- základem není relační algebra
- data mining
- méně zkušeností
- méně implementací (FastObjects, GOODS, PERST, db4o, ...)
- méně doplňkových nástrojů
- větší závislost databáze na aplikaci (a naopak)
- SQL je dostatečně dobré